Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa-rs1P17533 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa-rs1P17533 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms