Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tgfb3P17125 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tgfb3P17125 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tgfb3P17125 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tgfb3P17125 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tgfb3P17125 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tgfb3P17125 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tgfb3P17125 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tgfb3P17125 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tgfb3P17125 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tgfb3P17125 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tgfb3P17125 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tgfb3P17125 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tgfb3P17125 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tgfb3P17125 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tgfb3P17125 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tgfb3P17125 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tgfb3P17125 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tgfb3P17125 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms