Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sptan1P16546 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptan1P16546 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms