Protein–RNA interactions for Protein: P15532

Nme1, Nucleoside diphosphate kinase A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme1P15532 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme1P15532 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme1P15532 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme1P15532 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nme1P15532 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme1P15532 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nme1P15532 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nme1P15532 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nme1P15532 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nme1P15532 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nme1P15532 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nme1P15532 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms