Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd44P15379 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd44P15379 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd44P15379 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd44P15379 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd44P15379 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd44P15379 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd44P15379 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd44P15379 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd44P15379 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd44P15379 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd44P15379 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd44P15379 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd44P15379 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd44P15379 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd44P15379 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd44P15379 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd44P15379 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd44P15379 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd44P15379 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd44P15379 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd44P15379 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Cd44P15379 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd44P15379 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd44P15379 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd44P15379 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd44P15379 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd44P15379 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd44P15379 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd44P15379 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms