Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmnb1P14733 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmnb1P14733 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmnb1P14733 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmnb1P14733 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmnb1P14733 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmnb1P14733 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmnb1P14733 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmnb1P14733 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmnb1P14733 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmnb1P14733 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmnb1P14733 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmnb1P14733 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmnb1P14733 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmnb1P14733 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmnb1P14733 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmnb1P14733 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmnb1P14733 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmnb1P14733 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmnb1P14733 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmnb1P14733 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmnb1P14733 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmnb1P14733 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmnb1P14733 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmnb1P14733 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmnb1P14733 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmnb1P14733 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmnb1P14733 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmnb1P14733 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmnb1P14733 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmnb1P14733 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmnb1P14733 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmnb1P14733 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmnb1P14733 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmnb1P14733 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmnb1P14733 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmnb1P14733 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmnb1P14733 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmnb1P14733 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmnb1P14733 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmnb1P14733 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmnb1P14733 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmnb1P14733 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmnb1P14733 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmnb1P14733 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmnb1P14733 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmnb1P14733 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmnb1P14733 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmnb1P14733 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmnb1P14733 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmnb1P14733 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmnb1P14733 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmnb1P14733 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmnb1P14733 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmnb1P14733 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmnb1P14733 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmnb1P14733 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmnb1P14733 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmnb1P14733 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmnb1P14733 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmnb1P14733 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmnb1P14733 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmnb1P14733 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmnb1P14733 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmnb1P14733 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmnb1P14733 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmnb1P14733 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmnb1P14733 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmnb1P14733 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmnb1P14733 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Lmnb1P14733 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmnb1P14733 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Lmnb1P14733 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmnb1P14733 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmnb1P14733 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmnb1P14733 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmnb1P14733 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmnb1P14733 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmnb1P14733 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmnb1P14733 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmnb1P14733 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmnb1P14733 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmnb1P14733 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmnb1P14733 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmnb1P14733 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmnb1P14733 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmnb1P14733 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmnb1P14733 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmnb1P14733 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmnb1P14733 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmnb1P14733 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmnb1P14733 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmnb1P14733 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmnb1P14733 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmnb1P14733 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmnb1P14733 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmnb1P14733 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmnb1P14733 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmnb1P14733 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmnb1P14733 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms