Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga5P11688 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga5P11688 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga5P11688 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Itga5P11688 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga5P11688 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga5P11688 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga5P11688 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga5P11688 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga5P11688 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms