Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd4P10628 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.1 ms