Protein–RNA interactions for Protein: P10605

Ctsb, Cathepsin B, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsbP10605 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtsbP10605 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtsbP10605 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsbP10605 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtsbP10605 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtsbP10605 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtsbP10605 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtsbP10605 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtsbP10605 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms