Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nid1P10493 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nid1P10493 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nid1P10493 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nid1P10493 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nid1P10493 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nid1P10493 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms