Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P10404 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P10404 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P10404 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P10404 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P10404 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P10404 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P10404 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P10404 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P10404 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P10404 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P10404 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P10404 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P10404 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P10404 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P10404 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P10404 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P10404 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P10404 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P10404 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P10404 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P10404 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P10404 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P10404 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P10404 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P10404 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P10404 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P10404 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P10404 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P10404 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P10404 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P10404 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P10404 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P10404 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P10404 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P10404 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P10404 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P10404 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P10404 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P10404 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P10404 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P10404 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P10404 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P10404 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P10404 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P10404 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P10404 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P10404 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P10404 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P10404 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P10404 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P10404 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P10404 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P10404 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P10404 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P10404 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P10404 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P10404 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P10404 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P10404 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P10404 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P10404 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P10404 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P10404 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P10404 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P10404 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P10404 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P10404 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P10404 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P10404 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P10404 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P10404 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P10404 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P10404 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P10404 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P10404 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P10404 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P10404 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P10404 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P10404 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P10404 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P10404 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P10404 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P10404 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P10404 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P10404 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P10404 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P10404 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P10404 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P10404 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P10404 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P10404 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P10404 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P10404 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P10404 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P10404 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P10404 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P10404 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P10404 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P10404 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms