Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PolP10400 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PolP10400 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PolP10400 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PolP10400 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PolP10400 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PolP10400 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PolP10400 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PolP10400 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PolP10400 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PolP10400 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PolP10400 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PolP10400 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PolP10400 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PolP10400 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PolP10400 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PolP10400 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PolP10400 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PolP10400 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PolP10400 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PolP10400 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PolP10400 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PolP10400 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PolP10400 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PolP10400 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PolP10400 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PolP10400 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PolP10400 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PolP10400 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PolP10400 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PolP10400 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PolP10400 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PolP10400 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PolP10400 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PolP10400 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PolP10400 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PolP10400 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PolP10400 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PolP10400 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PolP10400 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PolP10400 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PolP10400 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PolP10400 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PolP10400 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PolP10400 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PolP10400 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PolP10400 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PolP10400 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PolP10400 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PolP10400 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PolP10400 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PolP10400 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PolP10400 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PolP10400 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PolP10400 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PolP10400 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PolP10400 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PolP10400 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PolP10400 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PolP10400 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PolP10400 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PolP10400 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PolP10400 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PolP10400 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PolP10400 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PolP10400 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PolP10400 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PolP10400 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PolP10400 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PolP10400 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PolP10400 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PolP10400 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PolP10400 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PolP10400 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PolP10400 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PolP10400 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PolP10400 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PolP10400 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PolP10400 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PolP10400 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PolP10400 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PolP10400 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PolP10400 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PolP10400 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PolP10400 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PolP10400 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PolP10400 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PolP10400 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PolP10400 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PolP10400 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PolP10400 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PolP10400 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PolP10400 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PolP10400 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PolP10400 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PolP10400 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PolP10400 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PolP10400 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PolP10400 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PolP10400 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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