Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Myod1P10085 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Myod1P10085 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Myod1P10085 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Myod1P10085 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Myod1P10085 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Myod1P10085 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Myod1P10085 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Myod1P10085 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Myod1P10085 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Myod1P10085 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Myod1P10085 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Myod1P10085 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Myod1P10085 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Myod1P10085 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Myod1P10085 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Myod1P10085 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Myod1P10085 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Myod1P10085 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Myod1P10085 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Myod1P10085 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Myod1P10085 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Myod1P10085 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Myod1P10085 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Myod1P10085 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Myod1P10085 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Myod1P10085 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Myod1P10085 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Myod1P10085 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Myod1P10085 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Myod1P10085 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Myod1P10085 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Myod1P10085 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Myod1P10085 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Myod1P10085 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Myod1P10085 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Myod1P10085 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Myod1P10085 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Myod1P10085 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Myod1P10085 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Myod1P10085 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Myod1P10085 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Myod1P10085 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Myod1P10085 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Myod1P10085 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Myod1P10085 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Myod1P10085 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Myod1P10085 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Myod1P10085 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Myod1P10085 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Myod1P10085 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Myod1P10085 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Myod1P10085 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Myod1P10085 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Myod1P10085 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Myod1P10085 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Myod1P10085 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Myod1P10085 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Myod1P10085 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Myod1P10085 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Myod1P10085 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Myod1P10085 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Myod1P10085 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms