Protein–RNA interactions for Protein: P0C673

Igsf11, Immunoglobulin superfamily member 11, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf11P0C673 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igsf11P0C673 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igsf11P0C673 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igsf11P0C673 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igsf11P0C673 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igsf11P0C673 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Igsf11P0C673 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Igsf11P0C673 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Igsf11P0C673 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Igsf11P0C673 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Igsf11P0C673 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Igsf11P0C673 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Igsf11P0C673 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Igsf11P0C673 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Igsf11P0C673 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Igsf11P0C673 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Igsf11P0C673 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Igsf11P0C673 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Igsf11P0C673 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Igsf11P0C673 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Igsf11P0C673 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms