Protein–RNA interactions for Protein: P08226

Apoe, Apolipoprotein E, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApoeP08226 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApoeP08226 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApoeP08226 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ApoeP08226 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ApoeP08226 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ApoeP08226 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ApoeP08226 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ApoeP08226 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ApoeP08226 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ApoeP08226 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ApoeP08226 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ApoeP08226 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ApoeP08226 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ApoeP08226 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ApoeP08226 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ApoeP08226 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ApoeP08226 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ApoeP08226 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ApoeP08226 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ApoeP08226 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ApoeP08226 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ApoeP08226 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ApoeP08226 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ApoeP08226 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ApoeP08226 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ApoeP08226 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ApoeP08226 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ApoeP08226 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ApoeP08226 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ApoeP08226 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ApoeP08226 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ApoeP08226 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ApoeP08226 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ApoeP08226 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ApoeP08226 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ApoeP08226 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ApoeP08226 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ApoeP08226 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ApoeP08226 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ApoeP08226 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ApoeP08226 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ApoeP08226 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms