Protein–RNA interactions for Protein: P07321

Epo, Erythropoietin, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EpoP07321 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EpoP07321 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EpoP07321 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EpoP07321 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EpoP07321 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EpoP07321 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EpoP07321 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EpoP07321 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EpoP07321 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EpoP07321 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EpoP07321 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EpoP07321 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EpoP07321 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EpoP07321 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EpoP07321 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EpoP07321 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EpoP07321 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EpoP07321 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EpoP07321 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EpoP07321 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EpoP07321 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EpoP07321 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EpoP07321 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EpoP07321 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EpoP07321 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EpoP07321 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EpoP07321 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EpoP07321 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EpoP07321 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EpoP07321 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EpoP07321 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EpoP07321 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EpoP07321 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EpoP07321 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
EpoP07321 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EpoP07321 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EpoP07321 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EpoP07321 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EpoP07321 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EpoP07321 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EpoP07321 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EpoP07321 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EpoP07321 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EpoP07321 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EpoP07321 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EpoP07321 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EpoP07321 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
EpoP07321 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EpoP07321 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EpoP07321 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
EpoP07321 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EpoP07321 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EpoP07321 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EpoP07321 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EpoP07321 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EpoP07321 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EpoP07321 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EpoP07321 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EpoP07321 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EpoP07321 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EpoP07321 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EpoP07321 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EpoP07321 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EpoP07321 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EpoP07321 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EpoP07321 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
EpoP07321 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EpoP07321 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EpoP07321 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EpoP07321 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EpoP07321 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EpoP07321 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EpoP07321 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EpoP07321 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EpoP07321 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EpoP07321 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EpoP07321 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EpoP07321 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EpoP07321 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EpoP07321 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EpoP07321 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EpoP07321 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EpoP07321 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EpoP07321 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EpoP07321 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EpoP07321 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EpoP07321 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EpoP07321 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EpoP07321 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EpoP07321 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EpoP07321 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EpoP07321 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EpoP07321 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EpoP07321 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EpoP07321 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EpoP07321 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EpoP07321 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EpoP07321 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EpoP07321 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EpoP07321 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms