Protein–RNA interactions for Protein: P06909

Cfh, Complement factor H, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CfhP06909 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CfhP06909 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CfhP06909 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CfhP06909 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CfhP06909 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CfhP06909 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CfhP06909 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CfhP06909 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CfhP06909 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CfhP06909 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CfhP06909 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CfhP06909 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CfhP06909 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CfhP06909 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CfhP06909 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CfhP06909 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CfhP06909 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CfhP06909 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CfhP06909 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CfhP06909 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CfhP06909 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CfhP06909 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CfhP06909 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CfhP06909 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CfhP06909 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CfhP06909 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CfhP06909 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CfhP06909 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CfhP06909 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CfhP06909 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CfhP06909 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CfhP06909 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CfhP06909 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CfhP06909 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CfhP06909 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CfhP06909 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CfhP06909 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CfhP06909 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CfhP06909 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CfhP06909 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CfhP06909 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CfhP06909 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CfhP06909 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CfhP06909 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CfhP06909 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CfhP06909 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CfhP06909 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CfhP06909 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CfhP06909 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CfhP06909 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CfhP06909 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CfhP06909 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CfhP06909 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CfhP06909 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CfhP06909 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CfhP06909 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CfhP06909 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CfhP06909 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CfhP06909 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CfhP06909 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CfhP06909 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CfhP06909 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CfhP06909 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CfhP06909 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CfhP06909 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CfhP06909 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CfhP06909 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CfhP06909 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CfhP06909 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CfhP06909 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CfhP06909 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CfhP06909 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CfhP06909 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CfhP06909 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CfhP06909 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CfhP06909 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CfhP06909 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CfhP06909 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CfhP06909 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CfhP06909 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CfhP06909 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CfhP06909 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CfhP06909 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CfhP06909 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CfhP06909 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CfhP06909 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CfhP06909 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CfhP06909 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CfhP06909 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CfhP06909 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CfhP06909 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CfhP06909 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CfhP06909 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CfhP06909 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CfhP06909 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CfhP06909 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CfhP06909 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CfhP06909 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CfhP06909 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CfhP06909 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms