Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TnfP06804 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TnfP06804 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TnfP06804 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TnfP06804 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TnfP06804 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TnfP06804 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TnfP06804 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TnfP06804 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TnfP06804 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TnfP06804 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TnfP06804 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TnfP06804 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TnfP06804 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TnfP06804 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TnfP06804 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TnfP06804 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TnfP06804 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TnfP06804 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TnfP06804 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TnfP06804 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TnfP06804 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TnfP06804 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TnfP06804 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TnfP06804 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TnfP06804 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TnfP06804 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TnfP06804 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TnfP06804 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TnfP06804 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TnfP06804 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TnfP06804 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TnfP06804 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TnfP06804 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TnfP06804 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TnfP06804 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TnfP06804 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TnfP06804 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TnfP06804 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TnfP06804 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TnfP06804 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TnfP06804 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TnfP06804 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TnfP06804 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TnfP06804 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TnfP06804 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TnfP06804 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TnfP06804 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TnfP06804 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TnfP06804 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TnfP06804 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TnfP06804 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TnfP06804 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TnfP06804 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TnfP06804 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TnfP06804 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TnfP06804 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TnfP06804 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TnfP06804 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TnfP06804 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TnfP06804 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TnfP06804 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TnfP06804 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TnfP06804 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TnfP06804 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TnfP06804 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TnfP06804 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TnfP06804 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TnfP06804 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TnfP06804 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TnfP06804 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TnfP06804 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TnfP06804 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TnfP06804 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TnfP06804 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TnfP06804 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TnfP06804 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TnfP06804 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TnfP06804 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TnfP06804 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TnfP06804 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TnfP06804 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TnfP06804 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TnfP06804 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TnfP06804 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TnfP06804 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TnfP06804 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TnfP06804 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TnfP06804 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TnfP06804 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TnfP06804 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TnfP06804 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TnfP06804 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TnfP06804 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TnfP06804 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TnfP06804 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TnfP06804 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TnfP06804 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TnfP06804 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TnfP06804 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms