Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxa7P02830 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxa7P02830 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms