Protein–RNA interactions for Protein: P01803

Ig heavy chain V region AMPC1, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01803 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01803 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01803 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01803 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01803 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01803 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01803 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01803 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01803 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01803 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01803 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01803 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01803 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01803 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01803 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01803 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01803 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01803 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01803 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01803 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01803 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01803 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01803 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01803 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01803 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01803 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01803 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01803 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01803 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01803 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P01803 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01803 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01803 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01803 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01803 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01803 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01803 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01803 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01803 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01803 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01803 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01803 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01803 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01803 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01803 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01803 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01803 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01803 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01803 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01803 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01803 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01803 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01803 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
P01803 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01803 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01803 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01803 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
P01803 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01803 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01803 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01803 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01803 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01803 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01803 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01803 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01803 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01803 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01803 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01803 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01803 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01803 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01803 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01803 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01803 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01803 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01803 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01803 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01803 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01803 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01803 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01803 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01803 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01803 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01803 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01803 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01803 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01803 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01803 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01803 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01803 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01803 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01803 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01803 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01803 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01803 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01803 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01803 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01803 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01803 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01803 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms