Protein–RNA interactions for Protein: P01658

Ig kappa chain V-III region MOPC 321, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01658 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01658 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01658 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P01658 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01658 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01658 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01658 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01658 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P01658 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P01658 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01658 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01658 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01658 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01658 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01658 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01658 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01658 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01658 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01658 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01658 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01658 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01658 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01658 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01658 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01658 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01658 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01658 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
P01658 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01658 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01658 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01658 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01658 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01658 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01658 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01658 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
P01658 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01658 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01658 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01658 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01658 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01658 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01658 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01658 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01658 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01658 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01658 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01658 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01658 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01658 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01658 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01658 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01658 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01658 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01658 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01658 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01658 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01658 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01658 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
P01658 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01658 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01658 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01658 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01658 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01658 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01658 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01658 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01658 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01658 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01658 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
P01658 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01658 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01658 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01658 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01658 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01658 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01658 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01658 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01658 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
P01658 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01658 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01658 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01658 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01658 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01658 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01658 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01658 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01658 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01658 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01658 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01658 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01658 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01658 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01658 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01658 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01658 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01658 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01658 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01658 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01658 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01658 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.4 ms