Protein–RNA interactions for Protein: P01572

Ifna1, Interferon alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna1P01572 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna1P01572 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms