Protein–RNA interactions for Protein: O89084

Pde4a, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde4aO89084 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pde4aO89084 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pde4aO89084 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pde4aO89084 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pde4aO89084 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pde4aO89084 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pde4aO89084 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pde4aO89084 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pde4aO89084 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pde4aO89084 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pde4aO89084 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pde4aO89084 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pde4aO89084 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pde4aO89084 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pde4aO89084 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pde4aO89084 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pde4aO89084 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pde4aO89084 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pde4aO89084 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pde4aO89084 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pde4aO89084 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pde4aO89084 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pde4aO89084 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pde4aO89084 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pde4aO89084 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms