Protein–RNA interactions for Protein: O89001

Cpd, Carboxypeptidase D, mousemouse

Predictions only

Length 1,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CpdO89001 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CpdO89001 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CpdO89001 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CpdO89001 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CpdO89001 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CpdO89001 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CpdO89001 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CpdO89001 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CpdO89001 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CpdO89001 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CpdO89001 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CpdO89001 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CpdO89001 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CpdO89001 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CpdO89001 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CpdO89001 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CpdO89001 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CpdO89001 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CpdO89001 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CpdO89001 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CpdO89001 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CpdO89001 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CpdO89001 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CpdO89001 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CpdO89001 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CpdO89001 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CpdO89001 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CpdO89001 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CpdO89001 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CpdO89001 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CpdO89001 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CpdO89001 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CpdO89001 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CpdO89001 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CpdO89001 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CpdO89001 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CpdO89001 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CpdO89001 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CpdO89001 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CpdO89001 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CpdO89001 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CpdO89001 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CpdO89001 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CpdO89001 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CpdO89001 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CpdO89001 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CpdO89001 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CpdO89001 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CpdO89001 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CpdO89001 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CpdO89001 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CpdO89001 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CpdO89001 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CpdO89001 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CpdO89001 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CpdO89001 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CpdO89001 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CpdO89001 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CpdO89001 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CpdO89001 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CpdO89001 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CpdO89001 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CpdO89001 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CpdO89001 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CpdO89001 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CpdO89001 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CpdO89001 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CpdO89001 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CpdO89001 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CpdO89001 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CpdO89001 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CpdO89001 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CpdO89001 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CpdO89001 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CpdO89001 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CpdO89001 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CpdO89001 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CpdO89001 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CpdO89001 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CpdO89001 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CpdO89001 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CpdO89001 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CpdO89001 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CpdO89001 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CpdO89001 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CpdO89001 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CpdO89001 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CpdO89001 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CpdO89001 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CpdO89001 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CpdO89001 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CpdO89001 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CpdO89001 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CpdO89001 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CpdO89001 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CpdO89001 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CpdO89001 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CpdO89001 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CpdO89001 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CpdO89001 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
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