Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hcn2O88703 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hcn2O88703 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms