Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
BlmO88700 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
BlmO88700 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
BlmO88700 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
BlmO88700 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
BlmO88700 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
BlmO88700 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
BlmO88700 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
BlmO88700 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
BlmO88700 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
BlmO88700 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
BlmO88700 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
BlmO88700 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
BlmO88700 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BlmO88700 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BlmO88700 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
BlmO88700 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BlmO88700 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BlmO88700 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
BlmO88700 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
BlmO88700 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
BlmO88700 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BlmO88700 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BlmO88700 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BlmO88700 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BlmO88700 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BlmO88700 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BlmO88700 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
BlmO88700 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BlmO88700 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BlmO88700 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BlmO88700 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BlmO88700 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
BlmO88700 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BlmO88700 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
BlmO88700 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
BlmO88700 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
BlmO88700 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
BlmO88700 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
BlmO88700 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
BlmO88700 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
BlmO88700 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BlmO88700 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BlmO88700 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BlmO88700 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
BlmO88700 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BlmO88700 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BlmO88700 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BlmO88700 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BlmO88700 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
BlmO88700 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
BlmO88700 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
BlmO88700 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
BlmO88700 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
BlmO88700 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
BlmO88700 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
BlmO88700 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
BlmO88700 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
BlmO88700 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
BlmO88700 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
BlmO88700 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
BlmO88700 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
BlmO88700 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
BlmO88700 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
BlmO88700 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
BlmO88700 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
BlmO88700 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
BlmO88700 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
BlmO88700 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
BlmO88700 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
BlmO88700 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
BlmO88700 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
BlmO88700 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
BlmO88700 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
BlmO88700 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
BlmO88700 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
BlmO88700 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BlmO88700 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BlmO88700 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BlmO88700 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
BlmO88700 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BlmO88700 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BlmO88700 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BlmO88700 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BlmO88700 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BlmO88700 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
BlmO88700 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
BlmO88700 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
BlmO88700 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
BlmO88700 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
BlmO88700 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
BlmO88700 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
BlmO88700 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
BlmO88700 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
BlmO88700 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
BlmO88700 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
BlmO88700 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
BlmO88700 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
BlmO88700 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
BlmO88700 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms