Protein–RNA interactions for Protein: O88609

Lmx1b, LIM homeobox transcription factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1bO88609 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmx1bO88609 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmx1bO88609 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmx1bO88609 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmx1bO88609 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmx1bO88609 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmx1bO88609 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmx1bO88609 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmx1bO88609 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmx1bO88609 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmx1bO88609 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmx1bO88609 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmx1bO88609 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmx1bO88609 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmx1bO88609 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmx1bO88609 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmx1bO88609 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmx1bO88609 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmx1bO88609 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmx1bO88609 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmx1bO88609 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmx1bO88609 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmx1bO88609 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmx1bO88609 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmx1bO88609 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmx1bO88609 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmx1bO88609 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmx1bO88609 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmx1bO88609 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmx1bO88609 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmx1bO88609 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmx1bO88609 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmx1bO88609 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmx1bO88609 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmx1bO88609 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmx1bO88609 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmx1bO88609 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmx1bO88609 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmx1bO88609 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmx1bO88609 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lmx1bO88609 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lmx1bO88609 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmx1bO88609 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmx1bO88609 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmx1bO88609 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmx1bO88609 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmx1bO88609 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmx1bO88609 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmx1bO88609 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmx1bO88609 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmx1bO88609 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmx1bO88609 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmx1bO88609 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmx1bO88609 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmx1bO88609 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmx1bO88609 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmx1bO88609 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmx1bO88609 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmx1bO88609 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmx1bO88609 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmx1bO88609 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmx1bO88609 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmx1bO88609 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmx1bO88609 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmx1bO88609 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmx1bO88609 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmx1bO88609 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmx1bO88609 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmx1bO88609 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmx1bO88609 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmx1bO88609 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmx1bO88609 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmx1bO88609 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmx1bO88609 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmx1bO88609 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmx1bO88609 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmx1bO88609 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmx1bO88609 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmx1bO88609 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmx1bO88609 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmx1bO88609 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmx1bO88609 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmx1bO88609 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmx1bO88609 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmx1bO88609 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmx1bO88609 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmx1bO88609 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmx1bO88609 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmx1bO88609 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmx1bO88609 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmx1bO88609 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmx1bO88609 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmx1bO88609 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmx1bO88609 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmx1bO88609 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmx1bO88609 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmx1bO88609 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmx1bO88609 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmx1bO88609 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmx1bO88609 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms