Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AurkcO88445 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AurkcO88445 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AurkcO88445 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AurkcO88445 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AurkcO88445 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AurkcO88445 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AurkcO88445 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AurkcO88445 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AurkcO88445 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AurkcO88445 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AurkcO88445 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AurkcO88445 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms