Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme6O88425 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme6O88425 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nme6O88425 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nme6O88425 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme6O88425 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme6O88425 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme6O88425 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme6O88425 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme6O88425 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme6O88425 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme6O88425 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme6O88425 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme6O88425 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme6O88425 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme6O88425 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms