Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itgb5O70309 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms