Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Supt5hO55201 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Supt5hO55201 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Supt5hO55201 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Supt5hO55201 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Supt5hO55201 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Supt5hO55201 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Supt5hO55201 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Supt5hO55201 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Supt5hO55201 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Supt5hO55201 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Supt5hO55201 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Supt5hO55201 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Supt5hO55201 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Supt5hO55201 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Supt5hO55201 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Supt5hO55201 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Supt5hO55201 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Supt5hO55201 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Supt5hO55201 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Supt5hO55201 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Supt5hO55201 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Supt5hO55201 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Supt5hO55201 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Supt5hO55201 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Supt5hO55201 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Supt5hO55201 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Supt5hO55201 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Supt5hO55201 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Supt5hO55201 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Supt5hO55201 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Supt5hO55201 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Supt5hO55201 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Supt5hO55201 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Supt5hO55201 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Supt5hO55201 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Supt5hO55201 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Supt5hO55201 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Supt5hO55201 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Supt5hO55201 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Supt5hO55201 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Supt5hO55201 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Supt5hO55201 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Supt5hO55201 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Supt5hO55201 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Supt5hO55201 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Supt5hO55201 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Supt5hO55201 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Supt5hO55201 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Supt5hO55201 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Supt5hO55201 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Supt5hO55201 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Supt5hO55201 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Supt5hO55201 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Supt5hO55201 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Supt5hO55201 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.2 ms