Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp2a2O55143 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms