Protein–RNA interactions for Protein: O55123

Mmp10, Stromelysin-2, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp10O55123 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms