Protein–RNA interactions for Protein: O55047

Tlk2, Serine/threonine-protein kinase tousled-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlk2O55047 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlk2O55047 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlk2O55047 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlk2O55047 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlk2O55047 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlk2O55047 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlk2O55047 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlk2O55047 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlk2O55047 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlk2O55047 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlk2O55047 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlk2O55047 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlk2O55047 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlk2O55047 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlk2O55047 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlk2O55047 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlk2O55047 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlk2O55047 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlk2O55047 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlk2O55047 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlk2O55047 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tlk2O55047 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tlk2O55047 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tlk2O55047 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tlk2O55047 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tlk2O55047 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tlk2O55047 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tlk2O55047 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tlk2O55047 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tlk2O55047 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tlk2O55047 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tlk2O55047 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tlk2O55047 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tlk2O55047 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms