Protein–RNA interactions for Protein: O55003

Bnip3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip3O55003 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bnip3O55003 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bnip3O55003 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bnip3O55003 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bnip3O55003 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bnip3O55003 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bnip3O55003 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bnip3O55003 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bnip3O55003 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bnip3O55003 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bnip3O55003 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bnip3O55003 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Bnip3O55003 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bnip3O55003 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bnip3O55003 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bnip3O55003 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bnip3O55003 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bnip3O55003 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bnip3O55003 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bnip3O55003 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bnip3O55003 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bnip3O55003 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bnip3O55003 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Bnip3O55003 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms