Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SlkO54988 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SlkO54988 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SlkO54988 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SlkO54988 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SlkO54988 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SlkO54988 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SlkO54988 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SlkO54988 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SlkO54988 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SlkO54988 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SlkO54988 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SlkO54988 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SlkO54988 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SlkO54988 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SlkO54988 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SlkO54988 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SlkO54988 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SlkO54988 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SlkO54988 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SlkO54988 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SlkO54988 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SlkO54988 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SlkO54988 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SlkO54988 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SlkO54988 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SlkO54988 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SlkO54988 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SlkO54988 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SlkO54988 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SlkO54988 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SlkO54988 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SlkO54988 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SlkO54988 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SlkO54988 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SlkO54988 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SlkO54988 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SlkO54988 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SlkO54988 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SlkO54988 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SlkO54988 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SlkO54988 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SlkO54988 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SlkO54988 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SlkO54988 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SlkO54988 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SlkO54988 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SlkO54988 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SlkO54988 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SlkO54988 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SlkO54988 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SlkO54988 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SlkO54988 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SlkO54988 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SlkO54988 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SlkO54988 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SlkO54988 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SlkO54988 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SlkO54988 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SlkO54988 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SlkO54988 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SlkO54988 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SlkO54988 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SlkO54988 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SlkO54988 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SlkO54988 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SlkO54988 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SlkO54988 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SlkO54988 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SlkO54988 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SlkO54988 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SlkO54988 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SlkO54988 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SlkO54988 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SlkO54988 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SlkO54988 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SlkO54988 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SlkO54988 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SlkO54988 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SlkO54988 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SlkO54988 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SlkO54988 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SlkO54988 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SlkO54988 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SlkO54988 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SlkO54988 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SlkO54988 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SlkO54988 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SlkO54988 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SlkO54988 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SlkO54988 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SlkO54988 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SlkO54988 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SlkO54988 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SlkO54988 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SlkO54988 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SlkO54988 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SlkO54988 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SlkO54988 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SlkO54988 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms