Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Sema6bO54951 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sema6bO54951 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Sema6bO54951 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sema6bO54951 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sema6bO54951 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sema6bO54951 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sema6bO54951 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sema6bO54951 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sema6bO54951 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Sema6bO54951 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sema6bO54951 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sema6bO54951 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sema6bO54951 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sema6bO54951 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sema6bO54951 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Sema6bO54951 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sema6bO54951 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sema6bO54951 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sema6bO54951 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sema6bO54951 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sema6bO54951 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sema6bO54951 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sema6bO54951 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sema6bO54951 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sema6bO54951 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sema6bO54951 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Sema6bO54951 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sema6bO54951 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Sema6bO54951 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sema6bO54951 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Sema6bO54951 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sema6bO54951 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Sema6bO54951 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sema6bO54951 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Sema6bO54951 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sema6bO54951 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sema6bO54951 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sema6bO54951 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sema6bO54951 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sema6bO54951 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sema6bO54951 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sema6bO54951 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sema6bO54951 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sema6bO54951 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sema6bO54951 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sema6bO54951 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sema6bO54951 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sema6bO54951 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sema6bO54951 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sema6bO54951 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sema6bO54951 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sema6bO54951 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sema6bO54951 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sema6bO54951 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Sema6bO54951 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sema6bO54951 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sema6bO54951 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sema6bO54951 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sema6bO54951 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sema6bO54951 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sema6bO54951 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Sema6bO54951 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sema6bO54951 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sema6bO54951 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Sema6bO54951 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Sema6bO54951 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Sema6bO54951 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sema6bO54951 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sema6bO54951 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sema6bO54951 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sema6bO54951 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sema6bO54951 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sema6bO54951 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sema6bO54951 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sema6bO54951 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sema6bO54951 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sema6bO54951 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sema6bO54951 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sema6bO54951 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sema6bO54951 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sema6bO54951 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Sema6bO54951 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sema6bO54951 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sema6bO54951 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sema6bO54951 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sema6bO54951 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sema6bO54951 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Sema6bO54951 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sema6bO54951 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sema6bO54951 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sema6bO54951 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sema6bO54951 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sema6bO54951 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sema6bO54951 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sema6bO54951 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Sema6bO54951 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sema6bO54951 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sema6bO54951 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sema6bO54951 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms