Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarce1O54941 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarce1O54941 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarce1O54941 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarce1O54941 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarce1O54941 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarce1O54941 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarce1O54941 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarce1O54941 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarce1O54941 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarce1O54941 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarce1O54941 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarce1O54941 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarce1O54941 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarce1O54941 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarce1O54941 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarce1O54941 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarce1O54941 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarce1O54941 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarce1O54941 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarce1O54941 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarce1O54941 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarce1O54941 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarce1O54941 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarce1O54941 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarce1O54941 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarce1O54941 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarce1O54941 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarce1O54941 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarce1O54941 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarce1O54941 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarce1O54941 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarce1O54941 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarce1O54941 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarce1O54941 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarce1O54941 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarce1O54941 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smarce1O54941 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Smarce1O54941 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smarce1O54941 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smarce1O54941 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smarce1O54941 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Smarce1O54941 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smarce1O54941 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smarce1O54941 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms