Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb3O54890 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb3O54890 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb3O54890 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb3O54890 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb3O54890 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itgb3O54890 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itgb3O54890 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itgb3O54890 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itgb3O54890 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itgb3O54890 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itgb3O54890 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itgb3O54890 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itgb3O54890 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb3O54890 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb3O54890 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb3O54890 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb3O54890 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb3O54890 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb3O54890 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb3O54890 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb3O54890 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb3O54890 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb3O54890 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Itgb3O54890 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms