Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TsksO54887 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TsksO54887 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TsksO54887 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TsksO54887 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TsksO54887 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TsksO54887 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TsksO54887 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TsksO54887 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TsksO54887 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TsksO54887 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TsksO54887 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TsksO54887 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TsksO54887 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TsksO54887 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TsksO54887 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TsksO54887 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TsksO54887 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TsksO54887 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TsksO54887 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TsksO54887 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TsksO54887 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TsksO54887 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TsksO54887 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TsksO54887 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TsksO54887 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TsksO54887 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TsksO54887 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TsksO54887 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TsksO54887 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TsksO54887 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TsksO54887 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TsksO54887 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TsksO54887 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TsksO54887 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TsksO54887 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TsksO54887 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TsksO54887 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TsksO54887 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TsksO54887 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TsksO54887 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TsksO54887 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TsksO54887 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TsksO54887 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TsksO54887 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TsksO54887 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TsksO54887 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TsksO54887 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TsksO54887 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TsksO54887 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TsksO54887 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TsksO54887 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TsksO54887 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TsksO54887 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TsksO54887 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TsksO54887 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TsksO54887 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TsksO54887 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TsksO54887 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TsksO54887 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TsksO54887 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TsksO54887 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TsksO54887 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TsksO54887 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TsksO54887 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TsksO54887 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TsksO54887 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TsksO54887 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TsksO54887 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TsksO54887 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TsksO54887 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TsksO54887 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TsksO54887 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TsksO54887 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TsksO54887 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TsksO54887 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TsksO54887 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TsksO54887 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TsksO54887 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TsksO54887 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TsksO54887 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TsksO54887 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TsksO54887 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TsksO54887 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TsksO54887 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TsksO54887 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TsksO54887 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TsksO54887 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TsksO54887 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TsksO54887 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TsksO54887 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TsksO54887 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TsksO54887 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TsksO54887 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TsksO54887 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TsksO54887 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TsksO54887 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TsksO54887 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TsksO54887 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TsksO54887 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms