Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CrxO54751 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CrxO54751 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CrxO54751 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CrxO54751 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CrxO54751 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CrxO54751 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CrxO54751 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CrxO54751 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CrxO54751 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CrxO54751 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CrxO54751 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CrxO54751 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CrxO54751 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CrxO54751 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CrxO54751 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CrxO54751 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CrxO54751 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CrxO54751 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CrxO54751 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CrxO54751 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CrxO54751 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CrxO54751 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CrxO54751 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CrxO54751 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CrxO54751 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CrxO54751 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CrxO54751 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CrxO54751 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CrxO54751 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CrxO54751 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CrxO54751 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CrxO54751 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CrxO54751 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CrxO54751 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CrxO54751 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CrxO54751 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CrxO54751 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CrxO54751 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CrxO54751 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CrxO54751 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CrxO54751 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CrxO54751 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CrxO54751 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CrxO54751 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CrxO54751 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CrxO54751 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CrxO54751 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CrxO54751 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CrxO54751 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CrxO54751 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CrxO54751 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CrxO54751 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CrxO54751 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CrxO54751 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CrxO54751 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CrxO54751 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CrxO54751 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CrxO54751 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CrxO54751 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CrxO54751 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CrxO54751 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CrxO54751 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CrxO54751 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CrxO54751 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CrxO54751 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CrxO54751 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CrxO54751 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CrxO54751 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CrxO54751 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CrxO54751 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CrxO54751 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CrxO54751 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CrxO54751 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CrxO54751 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CrxO54751 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CrxO54751 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CrxO54751 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CrxO54751 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CrxO54751 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CrxO54751 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CrxO54751 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CrxO54751 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CrxO54751 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CrxO54751 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CrxO54751 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CrxO54751 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CrxO54751 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CrxO54751 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CrxO54751 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CrxO54751 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CrxO54751 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CrxO54751 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CrxO54751 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CrxO54751 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CrxO54751 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CrxO54751 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CrxO54751 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CrxO54751 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CrxO54751 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1331.1 ms