Protein–RNA interactions for Protein: O35926

Cdk5r2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r2O35926 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdk5r2O35926 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cdk5r2O35926 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cdk5r2O35926 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdk5r2O35926 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdk5r2O35926 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdk5r2O35926 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdk5r2O35926 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdk5r2O35926 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdk5r2O35926 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdk5r2O35926 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdk5r2O35926 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdk5r2O35926 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdk5r2O35926 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdk5r2O35926 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdk5r2O35926 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdk5r2O35926 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdk5r2O35926 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdk5r2O35926 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdk5r2O35926 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms