Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppfibp2O35711 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppfibp2O35711 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppfibp2O35711 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppfibp2O35711 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppfibp2O35711 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppfibp2O35711 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppfibp2O35711 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppfibp2O35711 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppfibp2O35711 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppfibp2O35711 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppfibp2O35711 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppfibp2O35711 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppfibp2O35711 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppfibp2O35711 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppfibp2O35711 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppfibp2O35711 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppfibp2O35711 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppfibp2O35711 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppfibp2O35711 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppfibp2O35711 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppfibp2O35711 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppfibp2O35711 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppfibp2O35711 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppfibp2O35711 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppfibp2O35711 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppfibp2O35711 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppfibp2O35711 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppfibp2O35711 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppfibp2O35711 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppfibp2O35711 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppfibp2O35711 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppfibp2O35711 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppfibp2O35711 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppfibp2O35711 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppfibp2O35711 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppfibp2O35711 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppfibp2O35711 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppfibp2O35711 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppfibp2O35711 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppfibp2O35711 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppfibp2O35711 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppfibp2O35711 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppfibp2O35711 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppfibp2O35711 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppfibp2O35711 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppfibp2O35711 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppfibp2O35711 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppfibp2O35711 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppfibp2O35711 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppfibp2O35711 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppfibp2O35711 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppfibp2O35711 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppfibp2O35711 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppfibp2O35711 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppfibp2O35711 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppfibp2O35711 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppfibp2O35711 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppfibp2O35711 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ppfibp2O35711 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppfibp2O35711 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppfibp2O35711 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppfibp2O35711 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppfibp2O35711 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppfibp2O35711 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppfibp2O35711 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppfibp2O35711 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppfibp2O35711 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppfibp2O35711 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppfibp2O35711 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppfibp2O35711 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppfibp2O35711 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppfibp2O35711 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppfibp2O35711 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppfibp2O35711 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppfibp2O35711 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppfibp2O35711 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppfibp2O35711 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppfibp2O35711 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppfibp2O35711 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppfibp2O35711 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppfibp2O35711 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppfibp2O35711 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppfibp2O35711 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppfibp2O35711 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppfibp2O35711 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppfibp2O35711 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppfibp2O35711 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppfibp2O35711 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppfibp2O35711 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppfibp2O35711 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppfibp2O35711 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppfibp2O35711 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppfibp2O35711 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppfibp2O35711 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppfibp2O35711 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppfibp2O35711 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppfibp2O35711 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppfibp2O35711 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppfibp2O35711 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms