Protein–RNA interactions for Protein: O35492

Clk3, Dual specificity protein kinase CLK3, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk3O35492 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clk3O35492 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clk3O35492 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clk3O35492 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clk3O35492 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clk3O35492 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clk3O35492 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clk3O35492 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clk3O35492 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Clk3O35492 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clk3O35492 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clk3O35492 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Clk3O35492 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clk3O35492 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clk3O35492 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clk3O35492 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clk3O35492 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clk3O35492 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clk3O35492 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clk3O35492 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clk3O35492 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clk3O35492 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clk3O35492 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clk3O35492 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clk3O35492 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clk3O35492 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clk3O35492 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clk3O35492 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clk3O35492 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clk3O35492 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clk3O35492 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clk3O35492 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clk3O35492 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clk3O35492 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clk3O35492 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clk3O35492 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clk3O35492 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clk3O35492 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clk3O35492 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clk3O35492 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clk3O35492 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clk3O35492 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clk3O35492 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clk3O35492 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clk3O35492 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Clk3O35492 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clk3O35492 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clk3O35492 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clk3O35492 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clk3O35492 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clk3O35492 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clk3O35492 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clk3O35492 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clk3O35492 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clk3O35492 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clk3O35492 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clk3O35492 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Clk3O35492 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clk3O35492 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clk3O35492 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clk3O35492 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clk3O35492 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clk3O35492 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clk3O35492 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clk3O35492 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clk3O35492 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clk3O35492 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clk3O35492 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clk3O35492 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clk3O35492 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clk3O35492 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Clk3O35492 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clk3O35492 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clk3O35492 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clk3O35492 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clk3O35492 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clk3O35492 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clk3O35492 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clk3O35492 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clk3O35492 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clk3O35492 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clk3O35492 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clk3O35492 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clk3O35492 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clk3O35492 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clk3O35492 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clk3O35492 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk3O35492 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk3O35492 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk3O35492 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk3O35492 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk3O35492 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk3O35492 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk3O35492 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk3O35492 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk3O35492 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk3O35492 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk3O35492 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk3O35492 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk3O35492 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms