Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sema6aO35464 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sema6aO35464 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms