Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Abcc1O35379 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Abcc1O35379 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Abcc1O35379 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Abcc1O35379 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Abcc1O35379 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Abcc1O35379 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Abcc1O35379 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Abcc1O35379 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Abcc1O35379 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Abcc1O35379 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Abcc1O35379 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Abcc1O35379 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Abcc1O35379 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Abcc1O35379 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Abcc1O35379 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Abcc1O35379 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Abcc1O35379 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Abcc1O35379 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Abcc1O35379 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Abcc1O35379 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Abcc1O35379 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Abcc1O35379 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Abcc1O35379 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Abcc1O35379 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Abcc1O35379 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Abcc1O35379 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Abcc1O35379 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Abcc1O35379 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Abcc1O35379 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Abcc1O35379 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Abcc1O35379 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Abcc1O35379 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Abcc1O35379 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Abcc1O35379 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Abcc1O35379 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Abcc1O35379 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Abcc1O35379 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Abcc1O35379 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Abcc1O35379 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Abcc1O35379 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Abcc1O35379 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Abcc1O35379 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Abcc1O35379 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Abcc1O35379 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Abcc1O35379 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Abcc1O35379 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Abcc1O35379 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Abcc1O35379 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Abcc1O35379 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Abcc1O35379 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Abcc1O35379 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Abcc1O35379 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Abcc1O35379 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Abcc1O35379 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Abcc1O35379 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Abcc1O35379 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Abcc1O35379 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Abcc1O35379 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Abcc1O35379 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Abcc1O35379 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Abcc1O35379 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Abcc1O35379 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Abcc1O35379 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Abcc1O35379 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Abcc1O35379 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Abcc1O35379 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Abcc1O35379 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Abcc1O35379 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Abcc1O35379 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Abcc1O35379 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Abcc1O35379 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Abcc1O35379 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Abcc1O35379 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Abcc1O35379 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Abcc1O35379 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Abcc1O35379 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Abcc1O35379 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Abcc1O35379 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Abcc1O35379 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Abcc1O35379 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Abcc1O35379 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Abcc1O35379 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Abcc1O35379 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Abcc1O35379 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Abcc1O35379 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Abcc1O35379 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Abcc1O35379 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Abcc1O35379 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Abcc1O35379 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Abcc1O35379 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Abcc1O35379 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Abcc1O35379 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Abcc1O35379 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Abcc1O35379 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Abcc1O35379 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Abcc1O35379 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Abcc1O35379 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Abcc1O35379 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Abcc1O35379 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms