Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dgcr6O35347 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dgcr6O35347 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dgcr6O35347 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dgcr6O35347 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dgcr6O35347 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dgcr6O35347 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dgcr6O35347 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dgcr6O35347 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dgcr6O35347 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dgcr6O35347 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dgcr6O35347 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dgcr6O35347 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dgcr6O35347 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dgcr6O35347 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dgcr6O35347 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Dgcr6O35347 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dgcr6O35347 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dgcr6O35347 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dgcr6O35347 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Dgcr6O35347 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dgcr6O35347 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dgcr6O35347 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dgcr6O35347 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dgcr6O35347 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dgcr6O35347 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dgcr6O35347 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Dgcr6O35347 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dgcr6O35347 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dgcr6O35347 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dgcr6O35347 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dgcr6O35347 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dgcr6O35347 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dgcr6O35347 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dgcr6O35347 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dgcr6O35347 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dgcr6O35347 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dgcr6O35347 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Dgcr6O35347 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dgcr6O35347 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dgcr6O35347 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dgcr6O35347 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dgcr6O35347 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dgcr6O35347 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dgcr6O35347 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dgcr6O35347 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dgcr6O35347 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dgcr6O35347 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dgcr6O35347 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dgcr6O35347 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dgcr6O35347 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dgcr6O35347 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dgcr6O35347 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Dgcr6O35347 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dgcr6O35347 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dgcr6O35347 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dgcr6O35347 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dgcr6O35347 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms