Protein–RNA interactions for Protein: O35345

Kpna6, Importin subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna6O35345 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Kpna6O35345 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Kpna6O35345 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Kpna6O35345 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Kpna6O35345 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kpna6O35345 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kpna6O35345 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kpna6O35345 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kpna6O35345 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kpna6O35345 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kpna6O35345 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kpna6O35345 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kpna6O35345 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kpna6O35345 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kpna6O35345 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kpna6O35345 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kpna6O35345 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kpna6O35345 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kpna6O35345 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kpna6O35345 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kpna6O35345 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kpna6O35345 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kpna6O35345 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kpna6O35345 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kpna6O35345 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kpna6O35345 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kpna6O35345 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Kpna6O35345 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kpna6O35345 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kpna6O35345 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kpna6O35345 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kpna6O35345 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kpna6O35345 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kpna6O35345 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms