Protein–RNA interactions for Protein: O35066

Kif3c, Kinesin-like protein KIF3C, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3cO35066 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kif3cO35066 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kif3cO35066 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kif3cO35066 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kif3cO35066 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kif3cO35066 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kif3cO35066 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kif3cO35066 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kif3cO35066 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kif3cO35066 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kif3cO35066 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kif3cO35066 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kif3cO35066 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kif3cO35066 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kif3cO35066 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kif3cO35066 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kif3cO35066 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kif3cO35066 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kif3cO35066 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kif3cO35066 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kif3cO35066 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kif3cO35066 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kif3cO35066 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kif3cO35066 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kif3cO35066 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kif3cO35066 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kif3cO35066 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kif3cO35066 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kif3cO35066 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kif3cO35066 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kif3cO35066 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms