Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cldn4O35054 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms